Hola, Kornilios.
La idea del bien es el sujeto, estoy de acuerdo, pero ten en cuenta que nacer es un verbo intransitivo típico, por lo que no puede tener objeto directo.
La oración es lo que se conoce como una construcción enfática que responde a la siguiente transformación:
Oración normal: Esto ocurre por aquello.
Oración enfática: Es por aquello (por lo) que ocurre esto.
En este caso la construcción normal, no enfática, y ordenada sería:
La idea del bien nace en nosotros porque (nosotros) conocemos a los otros como protección, entrega o amorSub. Causal.
Aquí ya se observa mejor cual es la relación semántica y la función sintáctica que posee en la frase los valores mencionados: son predicativos del objeto directo (a los otros) del verbo transitivo de la subordinada causal (conocemos).
EDITO:
Cambio el orden de los pronombres en el ejemplo de transformación a enfática y añado que el por lo puede estar omitido como así es en la oración de este hilo.